Музей состоит из 5 залов: «История освоения Арктики», «Великие романтики Севера», «Жизненный путь В.И. Альбанова», «Поиски «Святой Анны»», «Герои Арктики – уроженцы Башкортостана».
Также в музее созданы специализированные помещения – кинозал и кают-компания. Здесь будут проводиться культурно-образовательных программы, «Уроки мужества», мастер-классы для самых разных групп посетителей. Центральное место в экспозиционном показе является история штурмана Альбанова, которая располагается на втором этаже.
Посетителей встречает вводный зал истории освоения Арктики и история трех известных экспедиций того периода – В.А. Русанова, Г.Я. Седова и Г.Л. Брусилова. Ключевые арт-объекты и художественные решения погрузят посетителя в непривычную, но увлекательную среду вечных снегов и суровой зимы. Современной истории изучения и поисков «пропавшей экспедиции» выделен отдельный зал.