Гробница представляет собой квадратное сооружение со сводчатым куполом. Материалом для её строительства послужили глыбы известняка. Уже в начале XIX века кэшэнэ было сильно разрушено, и в 1911 году уфимский муфтият принял решение восстановить мавзолей. Именно тогда он прибрел свой настоящий вид.

Тамерлан лишился на этом месте шести князей, велел их похоронить близ мавзолея и поставил над ними камни. Эти шесть камней послужили позднее основанием кладбища. Глава республики осмотрел и эти захоронения.

В 1985 году раскопки внутри мавзолея Хусейн-бека выявили девять погребений. Три из них принадлежали взрослым людям – двум мужчинам и одной женщине. Остальные – детям разного возраста.

В 2016 году останки Хусейн-бека перезахоронили после изъятия их в 1980-е годы для изучения. Мавзолей является почитаемой мусульманской святыней, памятником архитектуры и объектом культурного наследия федерального значения.

В беседе с журналистами Глава Башкортостана отметил, что мавзолей Хусейн-бека станет неотъемлемой частью будущего Евразийского музея кочевых цивилизаций.

– В этот праздничный день я решил исполнить свою давнюю мечту – побывать в мавзолее Хусейн-бека. Он был выдающимся человеком, первым проповедником ислама в Башкортостане. Об этом говорят документы, которые до нас дошли. Наверное, есть возможность покопаться в архивах для расширения наших знаний об этой личности, – сказал Радий Хабиров. – Этот мавзолей – шедевр архитектуры, важнейший объект с точки зрения науки и, конечно, поистине святое место для всех мусульман. В скором времени мы приведем его в порядок, и эта территория станет одним из важнейших элементов нашего Евразийского музея кочевых цивилизаций.